因為專為分辨便秘種類所做的檢查健保不會給付，而且必須在專門的醫療院所才能檢查，所以很難明確判定便秘的原因。但只要把症狀告訴醫師，大部分的診療科都能開治療便秘的藥物，所以可以先諮詢家庭醫師，觀察狀況。如果可能是器質性便秘，例如腸道疾病，就要去找專科醫師，但如果是功能性便秘可以先找附近的醫師諮詢，如果沒有改善再去看專科醫師。但也有可能是因為服用的藥物有造成便秘的副作用，例如感冒藥、止咳劑、用來治療花粉症的抗組織胺等等。另外年紀越大需要服用的藥物會越多，最好先了解藥物的副作用可能會導致便秘。
治療方面主要是利用藥物保守治療，基本上使用軟便劑一類的非刺激性藥物。刺激性瀉藥是緊急措施，最好避免長期使用。現在也多了許多中藥成分的瀉藥，但部分含有刺激性成分，需要注意。也可以利用比菲德氏菌來調整腸道環境。另外就是要對症下藥。如果是糞便到了肛門口，但排不出來，口服藥的效果就很有限，要使用栓劑和灌腸。如果沒辦法自行判斷，可以向內科、腸胃科、肛門科諮詢，請醫師開藥。
便秘有直腸性和弛緩性等不同類別，但我不會對病人使用這類醫學用語。我會根據「間隔多久大一次便」、「已經快出來了但還是大不出來嗎」、「糞便軟硬度」等症狀來給病人建議。我會使用簡單易懂的方式來建議病人如何改善，例如是硬便我就會說「要多喝水」，是腸胃蠕動不好就說「要多運動」。
治療便秘最重要的還是改善生活習慣。首先建議要早睡早起。人類會從小腸分泌出一種叫血清素的幸福激素，而曬早晨的太陽能促進血清素分泌。只要曬曬早晨的太陽對自己說「今天也要加油！」腸子的活動也會變得精力旺盛。
有很多人雖然沒有便秘，但誤以為自己有便秘，所以長期使用藥物。其實沒有每天排便並不算是便秘。雖然每天同時間排便是最理想的，但就算2、3天才大一次，只要排便順暢，沒有大不乾淨的感覺就沒問題。本院有一些病人是因為「想戒掉市售便秘藥」來求診。其中有一部分病人會因為服用太多便秘藥造成腹瀉。因為腹瀉，所以會有大不乾淨的感覺，臀部皮膚也會受損。我會建議這些病人改善生活習慣，停止使用成藥，改用持續使用也沒關係的內服藥。但停止使用成藥後便秘不會立即改善，所以我會建議病人先持續3天，如果沒有改善可以服用一次原本的藥物，並與病人一同分享喜悅「排便有比之前順暢喔」。保持「自己是做得到的」這種自信是很重要的。
